即将升上初中二年级的朝日奈未来,在春假的某天晚上,看到一神秘物体从天落入附近的公园里。“难道是魔法使?”,兴奋的未来第二天一早就和自小就喜爱着的绒毛玩具熊“毛芙伦”一起向公园前进。结果在那里看到的是……骑着扫帚漂浮在空中的女孩……自称是理子的那个女孩子,竟然是魔法使。
未来对魔法使非常感兴趣,对理子问东问西的。理子好像是为寻找“某物”而来到未来居住的世界。此外,仔细一看,她们两人带着同样的吊坠…。
就在此时,暗之魔法使多库罗克希的部下巴提在两人面前出现。他逼迫理子交出“波纹翡翠”(リンクルストーンエメラルド,Wrinkle Stone Emerald),但是理子好像也在寻找“波纹翡翠”……
当被巴提的黑暗魔法所诞生的怪物欲望怪逼入绝境时……未来和理子、还有毛芙伦手牵着手,不断地喊出魔法的咒文“Cure UpRapapa! ”,吊坠突然发出了光辉...
故事发生在风景秀丽民风淳朴的流川市,宇佐美奈奈子(伊藤美来 配音)是生活在那里的一名平凡的女高中生。市里新建的游泳池即将完工开门营业,奈奈子和朋友们越好到时候一起去玩。奈奈子想要一件新的泳装,无奈价格昂贵她只能向妈妈求助,然而妈妈却拒绝了奈奈子的请求,一时之间,奈奈子感到无计可施。
就在这个节骨眼上,在市政厅工作的奈奈子的叔叔太田(室园丈裕 配音)替奈奈子找了一份工作,奈奈子可以用打工赚来的钱去买泳衣了!就这样,在误打误撞之中,奈奈子竟然成为了流川市的当地偶像,并以此身份开始了一系列的宣传表演活动。
在赌上学校存续的大学选拔队战役中胜利後,大洗女子学园战车道成员终於能好好享受和平悠闲的冬季。迎接三年级生毕业典礼的到来,包含学生会改选与新执行部门的动作,学校开始发生些微的变化。有一天,一场骚动来访少女们。为了下一波难题与困难,战车道成员们再次挺身而出迎接挑战。
在魔法界一直流传着一个传说:如果谁被每100年出现一次的传说之石“愿望之石”选中的话,不管许什么样的愿望都能实现。这天光之美少女们出席了魔法界为庆祝这一盛事到来而举办的盛大祭典——“大魔法庆典”,而且在庆典上被愿望之石选中的竟然是未来的毛绒玩具熊莫夫伦。然而就在这时,神秘的谜之熊达克玛塔突然出现抓走了莫夫伦与愿望之石,妄想利用愿望之石实现其“消灭所有魔法使”的罪恶阴谋,为了救出莫夫伦并阻止达克玛塔的这一阴谋,光之美少女们展开了行动……