在静冈县三岛市,分别矗立着三所高中,分别是名校骏豆西高中、吊车尾云集的驹形大学附属三岛高中和全女子教会学校圣三岛女子学院。因当年礼拜堂火灾引发的事件,比邻而居的东高和三女互相仇视,不可调和。债台高筑的三女面临破产的命运,于是关于三女和佛教的东高合并的传言甚嚣尘上。在东高任教的原平助(锦户亮 饰)结合学生时代的经历,提出了设立男女实验班的设想,虽然两校负责人都对此不太感冒,但抱着不妨一试的态度还是通过了这个企划。在此之后,平助与有着暗黑之虎之称的三女生活指导老师蜂矢理沙(满岛光 饰)带着各自的学生来到了对方的阵营。
原本仇视敌对的男生女生,由此将上演一连串有趣而又感人的小故事……
新的一年,明修学苑理事长樱井凉子(黑木瞳 饰)带领麾下精英开赴湘南,宣布合并后的明修湘南高中的成立。内山田广志(田山凉成 饰)任副校长,而鬼冢英吉(AKIRA 饰)则担任2年A班的副班主任。与此同时,弹间龙二(城田优 饰)和冴岛俊行(山本裕典 饰)也因各种原因回到故乡,曾经大闹湘南的坏小孩们重聚湘南。鬼冢与高傲的女教师藤川穗奈美(比嘉爱未 饰)共同打理2年A班,宫地明里(三吉彩花 饰)、宇佐美太一(佐野玲于 饰)、芹泽航平(龙星凉 饰),一个个看似活泼享乐的新生代,却有着各自身体和心理上的创伤。GTO鬼冢决不允许自己坐视不管,他以独有的方式再次展开行动……
本片根据藤泽亨的同名漫画改编。